上海创新能力不断提升，42个项目分获2004年度国家自然科学奖、国家科技进步奖，占获奖总数的13.95％。上海获奖总数和一等奖数均创历史新高。 　　中科院上海光学精密机械研究所完成的《小型化OPCPA（光学参量啁啾脉冲放大）超短超强激光装置研究》等4个项目摘取国家科技进步一等奖。复旦大学赵东元教授等完成的《有序排列的纳米多孔材料的组装合成和功能化》等3个获奖项目，覆盖全球关注的生物技术、新材料和信息技术等热点领域。 　　在获奖的项目中，企业领衔完成的有15项，占获奖总数的35.71%，比重较往年有明显提升，这表明企业正逐步成为上海科技创新的主体。同时，42个获奖项目共申请专利206项，其中发明专利170项，显示上海科技原创力不断增强。 　　项目注重与产业化相结合，或用高新技术改造传统产业，已成为上海实现可持续发展的重要科技支撑。42个获奖项目，绝大多数瞄准科技制高点和经济增长点，应用型项目占87%。获奖项目中，有一批是与人民身体健康相关的医药医学项目及研究生态、资源、环境和可持续发展的项目。上海交大等单位完成《个性化假体CAD/CAM技术与计算机辅助临床工程系统》项目，建成个性化假体数字制造系统，已向全国16省市提供新一代假体。水产大学李思发教授15年选育出世界草食性鱼类的首例良种???团头鲂“浦江1号”；同济大学高廷耀教授10年心系居民用水安全，填补了我国大型源水生物处理理论研究与工程实践的空白。